siRNA，shRNA，dsRNA，miRNA間的區(qū)別
RNA干擾（RNAi），即用20多個(gè)核苷酸組成的短的雙鏈RNA（siRNA）代替?zhèn)鹘y(tǒng)反義核酸進(jìn)行轉(zhuǎn)錄后基因沉默，已經(jīng)迅速而廣泛地應(yīng)用到基因功能，基因表達(dá)調(diào)控機(jī)制研究等熱門領(lǐng)域，并為基因治療開辟了新的途徑。近兩年來，這方面的科學(xué)論文及報(bào)道爆炸性增長(zhǎng)，幾乎每天都有新的結(jié)果涌現(xiàn)。這些論文中，出現(xiàn)了很多與RNA干擾相關(guān)的概念，意思很相近但并不完全相同，這里列舉了幾個(gè)常見的RNA干擾相關(guān)的名詞及其簡(jiǎn)單的解釋：
1、 miRNA：在遺傳學(xué)中，微RNA（microRNAs，miRNA）是長(zhǎng)度在21-23個(gè)核苷酸之間的單鏈RNA片段，調(diào)節(jié)基因的表達(dá)。miRNA由基因編碼，從DNA轉(zhuǎn)錄而來，但不翻譯成蛋白。初級(jí)轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物（primary transcripts，pri-miRNA）縮短其頸環(huán)結(jié)構(gòu)得到功能性的miRNA。成熟的miRNA分子與一個(gè)或更多個(gè)mRNA分子部分互補(bǔ)，其主要功能是下調(diào)基因的表達(dá)。而microRNA這個(gè)概念第一次在2001年Science (26 October 2001)的文章中出現(xiàn)。
2、 dsRNA：雙鏈RNA（double-stranded RNA, dsRNA）是一種有互補(bǔ)鏈的RNA，與細(xì)胞中發(fā)現(xiàn)的DNA相似，dsRNA構(gòu)成了一些病毒（雙鏈RNA病毒）的基因組。像病毒RNA或siRNA之類的雙鏈RNA能夠促發(fā)真核細(xì)胞中的RNA干擾，引起脊椎動(dòng)物中的干擾素反應(yīng)。
3、 shRNA：小發(fā)卡或短發(fā)卡RNA（a small hairpin RNA or short hairpin RNA, shRNA）是一段具有緊密發(fā)卡環(huán)（tight hairpin turn）的RNA序列，常被用于RNA干擾沉默靶基因的表達(dá)。利用載體把shRNA導(dǎo)入細(xì)胞，載體中的U6 啟動(dòng)子確保shRNA總是表達(dá)；這種裝載了shRNA載體可被傳遞到子代細(xì)胞中去，從而使基因的沉默可被遺傳。shRNA的發(fā)卡結(jié)構(gòu)可被細(xì)胞機(jī)制切割成siRNA，然后siRNA結(jié)合到RNA誘導(dǎo)沉默復(fù)合物上（RNA-induced silencing complex，RISC），該復(fù)合物能夠結(jié)合到目的mRNAs并將其降解。shRNA 是由RNA 聚合酶Ⅲ轉(zhuǎn)錄的，哺乳細(xì)胞中的shRNA產(chǎn)物有時(shí)會(huì)促使細(xì)胞產(chǎn)生干擾素反應(yīng)（細(xì)胞遇到病毒侵襲時(shí)做出的自我防衛(wèi)反應(yīng)），而miRNA中卻不會(huì)遇到這種問題（miRNA是由RNA聚合酶Ⅱ轉(zhuǎn)錄，與轉(zhuǎn)錄mRNA的聚合酶相同）。shRNA也被用于植物和其它系統(tǒng)中，在這些系統(tǒng)中不需要U6啟動(dòng)子的驅(qū)動(dòng)。在植物中，常用的增強(qiáng)表達(dá)的啟動(dòng)子是CaMV35S（cauliflower mosaic virus 35S）,在這種情況下，RNA聚合酶Ⅱ參與了轉(zhuǎn)錄，起始RNA干擾。
4、 siRNA：小或短干擾RNA（small/short interfering RNA, siRNA）是一類20-25個(gè)核苷酸長(zhǎng)度的雙鏈RNA分子，其主要在RNAi通路中起作用，干擾特異基因的表達(dá)。此外siRNA在RNAi相關(guān)的通路中也起作用，如抗病毒機(jī)制，基因組染色體結(jié)構(gòu)的塑造等。其結(jié)構(gòu)是一段完全互補(bǔ)的RNA雙鏈，兩端各有兩個(gè)未互補(bǔ)的的堿基。
最后做一下小結(jié)，miRNA，siRNA，dsRNA和shRNA都是RNA干擾技術(shù)中用到的小分子RNA，其不同之處在miRNA 是單鏈RNA，其余均為雙鏈RNA；siRNA和dsRNA相似；shRNA需通過載體導(dǎo)入細(xì)胞后，然后利用細(xì)胞內(nèi)的酶切機(jī)制得到siRNA而最終發(fā)揮RNA干擾作用。
